การสำรวจเชื้อ Acinetobacter baumannii ที่ดื้อยาหลายขนานโดยพีซีอาร์ ด้วยยีนคล้าย MexA, MexB และ 16S – 23S rRNA Intergenic Spacer Region (ISR)

PCR for Screening of Multidrug Resistant Acinetobacter baumanniiby MexA, MexB Like Gene and 16-23S rRNA Intergenic Spacer Region (ISR)

Abstract

งานวิจัยนี้ได้ทำการจำแนกเชื้อ Acinetobacter baumannii ที่ดื้อยาหลายขนาน ด้วยยีนคล้าย MexA และ MexB ที่แยกได้จากผู้ป่วย โดยเปรียบเทียบยีนนี้กับเชื้อฉวยโอกาสอื่น ด้วยวิธี PCR และยืนยันสายพันธุ์ด้วยยีนตำแหน่ง 16S – 23S rRNA Intergenic Spacer Region (ISR) ผลการวิจัยนี้แสดงให้เห็นว่า สามารถเพิ่มขยายดีเอ็นเอที่คล้ายยีน MexA และ MexB จาก A. baumannii ซึ่งพบเฉพาะในเชื้อแบคทีเรีย A. baumannii ที่ดื้อยาหลายขนาน และจะไม่พบใน A. baumannii ที่ไม่ดื้อยา จากตัวอย่างที่เก็บจากโรงพยาบาลระยองและโรงพยาบาลชลบุรี ในระหว่างเดือนมีนาคม ถึง ธันวาคม ปี พ.ศ.2559 ดังนั้นงานวิจัยนี้แสดงให้เห็นว่ามีการแพร่กระจายของยีนเหล่านี้ทั้งใน 2 จังหวัด และยีนคล้าย Mex A และ MexB ที่ค้นพบนี้มีขนาด 1,175 และ 2,300 คู่เบสตามลำดับ ผลการยืนยันสายพันธุ์ด้วย ISR พบว่าเชื้อ A. baumannii รวมทั้งสายพันธุ์ที่ดื้อยาและไม่ดื้อยาปฏิชีวนะทั้ง 20 ตัวอย่าง แสดงแถบของ ISR ซึ่งมีขนาด 1,258 คู่เบส ดังนั้นการวิเคราะห์ยีนดื้อยาของ A. baumannii ออกจากเชื้อฉวยโอกาสอื่นๆ ด้วยวิธีพีซีอาร์นี้สามารถนำไปใช้ศึกษารูปแบบการวิวัฒนาการของเชื้อดื้อยา รวมถึงการศึกษาอุบัติการณ์การระบาดเพื่อหาแนวทางการรักษาและการป้องกันในอนาคต            This research was aimed to identify MexA and MexB like gene in Acinetobacter baumannii from clinical isolates and compare it among some opportunistic bacteria. The MexA and MexB gene was analyzed and compared by PCR and confirmed the difference of A. baumannii among other species by 16S - 23S rRNA Intergenic Spacer Region (ISR). The results of research could amplify both the MexA and MexB like DNAs from multidrug-resistant A. baumannii of which was not found in nondrug-resistant A. baumannii among all clinical isolates from Rayong Hospitals and Chonburi Hospital, collected during March to December 2016. Thus, the research was revealed that these Mex A and MexB like genes dispread in the two provinces, and these genes contained PCR products of 1,175 and 2,300 base pairs, respectively. Also, identification of A. baumannii by using ISR primer could indicate that twenty isolates of both multidrug-resistant A. baumannii and non multidrug-resistant A. baumannii contained 1,258 base pairs of ISR. Thus, PCR could be applied to select out multidrug-resistant A. baumannii and discrete from other opportunistic bacteria. This method also included to study evolution of resistant bacteria and incidence of outbreaks for treatment and prevention of A. baumannii infection in the future.