การใช้เทคนิคอาร์เอพีดีศึกษาความสัมพันธ์ทางพันธุกรรมของพุดสกุลการ์ดีเนีย
Using Random Amplified Polymorphic DNA Technique for Studying the Genetic Relationship of Gardenia spp.
Keywords:
พุด อาร์เอพีดี , ความหลากหลายทางพันธุกรรมAbstract
การศึกษาความสัมพันธ์ทางพันธุกรรมของพุดสกุลการ์ดีเนีย 9 พันธุ์ ด้วยเทคนิคอาร์เอพีดีโดยใช้ไพรเมอร์แบบสุ่ม 72 ชนิด พบว่าไพรเมอร์ 59 ชนิด สามารถเพิ่มปริมาณดีเอ็นเอได้ เมื่อคัดเลือกไพรเมอร์ 20 ชนิด ที่ให้ลายพิมพ์ดีเอ็นเออย่างชัดเจนมาวิเคราะห์ความหลากหลายทางพันธุกรรม พบว่าสามารถแยกความแตกต่างระหว่างพันธุ์ได้ด้วยแถบดีเอ็นเอที่จำเพาะกับพันธุ์นอกจากนั้นยังพบไพรเมอร์ที่สามารถจำแนกพุดทั้ง 9 พันธุ์ ได้ด้วยไพรเมอร์เพียงชนิดเดียว เมื่อวิเคราะห์ความสัมพันธ์ทางพันธุกรรมพบว่าสามารถจำแนกพุดสกุลการ์ดีเนียได้เป็น 4 กลุ่ม โดยมีค่าสัมประสิทธิ์ความเหมือนอยู่ระหว่าง 0.38 ถึง 0.81 Random amplified polymorphic DNA (RAPD) technique was used to study the genetic relationship among 9 cultivated Gardenia spp. Seventy-two random primers were screened and 59 primers could be used for DNA amplification. Twenty primers which gave clear amplified products were selected and used to analyze all cultivars. The result showed significant differences among 9 cultivars having specific fragments for each cultivar. Furthermore, There are some primers which are able to identify all cultivars using only one primer. A dendrogram constructed based on polymorphic bands showed genetic similarities among Gardenia spp. and separated to 4 clusters with similarity coefficients ranging 0.38-0.81.References
ธีระชัย ธนานันต์ และนฤมล ธนานันต์. (2543). เทคนิคอาร์เอพีดีกับการจำแนกพันธุ์พริก. วารสารวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยี 8 (1), 6-10.
นฤมล ธนานันต์ และมานะ ขาวเมฆ. (2549). การจำแนกพันธุ์บัวหลวงด้วยเครื่องหมายอาร์เอพีดี. วารสารวิจัยและพัฒนาวไลยอลงกรณ์ ในพระบรมราชูปถัมภ์ 1(3), 15-23.
ธีระชัย ธนานันต์. (2550). การจำแนกน้อยหน่าพันธุ์เนื้อและพันธุ์หนังด้วยเครื่องหมายอาร์เอพีดี. วารสารวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยี 15(1), 9-15.
Agrawal, G.K., Pandey, R.N. & Agrawal, V.P. (1992). Isolation of DNA from Choerospondias asillaris leaves. Biotechnology and Biodiversity Letters, 2, 19-24.
Bradshaw, J. (2003). Gardenias. Florida: University of Florida, Cooperative Extension Service, IFAS.
Han, J., Zhang, W., Cao, H., Chen, S. & Wang, Y. (2007). Genetic diversity and biogeography of the traditional Chinese medicine, Gardenia jasminoides, based on AFLP markers. Biochemical Systematics and Ecology, 35, 138-145.
Kobayashi, K.D. & Kaufman, A.J. (2006). Common Gardenia. Hawaii: University of Hawaii at Manoa, College of Tropical Agriculture and Human Resources, Cooperative Extension Service, OF-32.
Lee, P., Lee, J., Choi, S.Y., Lee, S.E., Lee, S. & Son, D. (2006). Geniposide from Gardenia jasminoides attenuates neuronal cell death in oxygen and glucose deprivation-exposed rat hippocampal slice culture. Biological & Pharmaceutical Bulletin, 29, 174-176.
Rohlf, F.J. (2002). NTSYpc Numerical Taxonomy and Multivariate Analysis System. New York: Applied Biostatistics, Inc.
Sambrook, J., Fritsch, E.F. & Maniatis, T. (1989). Molecular Cloning: A Laboratory Manual. 2nd Ed. New York: Cold Spring Harbor Laboratory.
